Theo phân tích của chuyên gia và các doanh nghiệp, Hóa đơn điện tử đã và đang mang lại rất nhiều lợi ích cho người sử dụng:  

Đối với  doanh nghiệp

• Giảm chi phí giấy, mực trong việc in ấn hóa đơn
• Tiết kiệm chi phí chuyển phát nhanh hóa đơn cho khách hàng
• Tiết kiệm chi phí kho bãi lưu trữ, bảo quản hóa đơn giấy thông thường
• Giảm tuyệt đối tình trạng thất lạc, mất hóa đơn khi gửi nhận qua đường bưu điện, tình trạng cháy, hỏng, rách, nhàu nát hóa đơn
• Tiết kiệm thời gian cho doanh nghiệp trong khâu phát hành, xuất hóa đơn thủ công
• Doanh nghiệp có thể tạo lập và gửi hóa đơn cho khách hàng ngay sau khi bán hàng và cung cấp dịch vụ thông qua: email, website, tin nhắn SMS …

Đối với khách hàng của doanh nghiệp sử dụng

• Có thể nhận hóa đơn sau khi mua hàng hoặc sử dụng dịch vụ
• Đa dạng hình thức tiếp nhận hóa đơn: Email, Website, SMS
• Thuận tiện tra cứu hóa đơn online mọi lúc mọi nơi.
• Không lo sợ thất lạc, mất hóa đơn (đã được lưu trên web của đơn vị phát hành)
• Tránh rủi ro sử dụng hóa đơn giả mạo bất hợp pháp của các công ty “ma”

Đối với cơ quan quản lý (cơ quan Thuế)

• Có thể thanh tra, kiểm tra tất cả các hóa đơn nhanh chóng, chính xác, toàn diện
• Quản lý triệt để nạn làm giả hóa đơn, tạo môi trường kinh doanh lành mạnh.
• Khắc phục tình trạng sử dụng bất hợp pháp hóa đơn – lập hóa đơn sai lệch giữa các liên.